Manipulation d’échantillons cliniques : rôle, qualité et limites

La manipulation d’échantillons cliniques ne désigne pas une maladie, mais un ensemble d’opérations techniques liées notamment au prélèvement, à l’identification, à l’évaluation de la qualité et à l’acheminement d’un échantillon destiné à une analyse. [1] [2] La méthode dépend du type d’échantillon, du test prévu et des conditions dans lesquelles le prélèvement est réalisé. [1] [2] Une collecte ou une manipulation inadaptée peut rendre l’échantillon inexploitable ou diminuer la fiabilité du résultat. [1] [2] Cette fiche se limite toutefois à deux exemples spécialisés : les prélèvements respiratoires pour la recherche du SARS-CoV-2 dans un cadre américain et les prélèvements anatomopathologiques obtenus par ponction sous échoendoscopie. Elle ne décrit donc pas l’ensemble du processus préanalytique ni les règles applicables en France. [1] [2]

Pourquoi la qualité de l’échantillon est-elle importante ?

Dans les recommandations du CDC relatives au dépistage du SARS-CoV-2, une mauvaise collecte peut conduire au rejet de l’échantillon ou à un résultat faux ou non concluant. [1] Le type de prélèvement compatible doit être déterminé en fonction du test réalisé et des instructions de son fabricant. [1] Le document recommande également de vérifier avant le prélèvement que le laboratoire accepte le type d’échantillon envisagé. [1] Ces différences expliquent pourquoi une technique de prélèvement ou de manipulation décrite pour un test précis ne doit pas être transposée automatiquement à un autre test. [1]

Identification et intégrité de l’échantillon

Dans le cadre réglementaire américain présenté par le CDC, le laboratoire doit vérifier que l’échantillon a été correctement obtenu et qu’il correspond bien à la personne testée. [1] Le même document associe l’intégrité de l’échantillon à une identification positive reposant sur au moins deux identifiants distincts ou uniques. [1] Il indique aussi que la demande d’analyse comporte notamment le test demandé, l’origine de l’échantillon ainsi que la date et, lorsque cela est approprié, l’heure du prélèvement. [1]

Qui peut réaliser le prélèvement ?

Pour le dépistage du SARS-CoV-2 décrit par le CDC, certains prélèvements nasaux peuvent être effectués par le patient après lecture et respect des instructions de collecte. [1] À l’inverse, les prélèvements nasopharyngés et oropharyngés présentés dans ce document doivent être réalisés par un professionnel de santé formé et ne sont pas adaptés à l’autoprélèvement. [1] Certains prélèvements des voies respiratoires inférieures, comme le lavage bronchoalvéolaire ou l’aspiration trachéale, nécessitent davantage de compétences et de matériel et sont généralement réalisés à l’hôpital. [1] La possibilité d’un autoprélèvement dépend donc du prélèvement et du test concernés, et non de la seule accessibilité apparente de la zone à prélever. [1]

Évaluation des échantillons obtenus par ponction sous échoendoscopie

La ponction ou biopsie à l’aiguille fine sous échoendoscopie permet d’obtenir des échantillons pathologiques à partir de lésions situées dans ou près du tube digestif. [2] Dans ce contexte spécialisé, la manipulation de l’échantillon contribue à préserver la qualité du matériel nécessaire à l’analyse cytologique ou histologique. [2] Une évaluation cytologique rapide sur place peut examiner immédiatement une partie du prélèvement après une coloration effectuée dans la salle d’endoscopie. [2] Cette évaluation fournit un retour immédiat sur la présence de matériel cytologique suffisant et peut aider l’endoscopiste à décider quand arrêter les passages de l’aiguille. [2] Une autre méthode, appelée évaluation macroscopique sur place, consiste à examiner visuellement le prélèvement afin de rechercher des fragments de tissu susceptibles d’indiquer que sa quantité est suffisante. [2]

Évaluation rapide et résultat définitif

L’évaluation rapide réalisée pendant une ponction sous échoendoscopie peut fournir une orientation préliminaire, mais elle intervient dans l’attente du résultat anatomopathologique définitif. [2] La méthode d’évaluation la plus adaptée peut varier selon l’objectif du prélèvement, le type d’aiguille, les ressources du centre et les pratiques de l’endoscopiste. [2] Les applications de l’intelligence artificielle à l’évaluation rapide de ces prélèvements restent au stade de la recherche dans la revue disponible. [2]