Hybridation in situ fluorescente (FISH) : principe, utilisations et limites

L’hybridation in situ fluorescente, souvent désignée par le sigle anglais FISH, est un examen ciblé utilisé pour rechercher certaines anomalies génétiques dans des cellules. [1] [5] [7] Elle peut contribuer au diagnostic ou au suivi de certaines maladies, mais la cible recherchée et la portée du résultat dépendent étroitement de la situation clinique. [1] [2] [3] [6] Une FISH n’est donc pas un test unique capable de dépister indistinctement toutes les anomalies chromosomiques ou tous les cancers. [1] [3] [4] [5]

Que recherche une analyse FISH ?

L’analyse emploie des sondes choisies pour une anomalie génétique précise, puis les signaux obtenus sont examinés sur les cellules. [1] [5] Dans une étude consacrée à la leucémie myéloïde chronique, une sonde à deux couleurs a ainsi été utilisée pour rechercher le réarrangement BCR/ABL1 sur des noyaux en interphase et des métaphases. [1] Dans le diagnostic de certains sarcomes, les sondes peuvent au contraire cibler des anomalies concernant notamment EWSR1, SS18 ou MDM2. [5] Le résultat doit donc toujours être lu en fonction de la sonde employée et de l’anomalie que le laboratoire avait pour objectif de rechercher. [1] [5] [4]

Sur quels prélèvements la FISH peut-elle être réalisée ?

Le matériau analysé varie selon la maladie et la question posée. [1] [3] [4] [5] [6] La FISH a notamment été réalisée sur des cellules sanguines pour rechercher BCR/ABL1 dans la leucémie myéloïde chronique. [1] Elle peut également être appliquée à des tissus fixés au formol et inclus en paraffine dans le cadre du diagnostic anatomopathologique de certaines tumeurs des tissus mous. [5] Des travaux ont aussi évalué des analyses FISH sur des échantillons urinaires, des prélèvements cervicaux ou des prélèvements des voies biliaires. [3] [4] [6] Ces exemples ne permettent pas de déterminer à eux seuls quel prélèvement convient à une personne donnée. [1] [3] [4] [5] [6]

Dans quelles situations cet examen est-il utilisé ?

En hématologie, la FISH peut rechercher le gène de fusion BCR/ABL1, qui caractérise la leucémie myéloïde chronique avec le chromosome Philadelphie. [1] Dans l’étude malienne disponible, cette recherche a été employée aussi bien pour le diagnostic que pour l’évaluation thérapeutique de patients atteints de leucémie myéloïde chronique. [1] En anatomopathologie, l’analyse moléculaire peut aider à classer des tumeurs des tissus mous lorsque leur aspect morphologique ne suffit pas à établir avec certitude le sous-type. [5] La FISH a également été étudiée comme outil diagnostique dans le mésothéliome malin, le cancer de la vessie, certaines anomalies du col de l’utérus et le cholangiocarcinome associé à une cholangite sclérosante primitive. [2] [3] [4] [6] Dans le cancer du sein, elle a aussi été étudiée comme examen complémentaire pour évaluer une anomalie du gène HER2 en comparaison avec l’immunohistochimie. [7]

Comment comprendre un résultat positif ou négatif ?

Un résultat positif indique que l’anomalie ciblée par la sonde a été détectée selon les critères de l’analyse. [1] [5] Un résultat négatif signifie que cette cible n’a pas été mise en évidence, mais il ne permet pas d’exclure toutes les autres anomalies possibles. [2] [3] [4] [6] L’interprétation peut aussi être plus complexe lorsque le profil des signaux est atypique. [1] Dans l’étude sur la leucémie myéloïde chronique, des profils atypiques ont été observés chez certains patients porteurs d’un réarrangement BCR/ABL1. [1]

Quelles sont les limites de la FISH ?

Les performances de la FISH ne sont pas identiques pour toutes les maladies, toutes les sondes ni tous les types de prélèvements. [2] [3] [4] [6] Les revues disponibles rapportent des sensibilités et des spécificités différentes selon que l’analyse concerne un mésothéliome, un cancer de la vessie, une anomalie cervicale ou un cholangiocarcinome. [2] [3] [4] [6] Dans les études sur les anomalies cervicales, les sondes et les seuils de positivité variaient, et les données étaient jugées limitées par le petit nombre d’études dans plusieurs sous-groupes. [4] Dans la revue consacrée au cancer de la vessie, une hétérogénéité importante entre les études limitait la solidité des estimations regroupées. [3] Pour le cholangiocarcinome associé à la cholangite sclérosante primitive, la bonne spécificité de la polysomie détectée par FISH s’accompagnait d’une sensibilité limitée. [6] Ces limites expliquent pourquoi un résultat FISH doit être intégré aux autres données cliniques et anatomopathologiques plutôt qu’interprété isolément. [3] [4] [5] [6] [7]