Test pharmacogénomique : principe, interprétation et exemple de la warfarine

Un test pharmacogénomique recherche des variations génétiques susceptibles d’influencer la manière dont une personne répond à un médicament. [2] Son résultat peut contribuer à prévoir une réponse favorable, défavorable ou absente, mais il ne constitue qu’un des éléments à prendre en compte pour guider le traitement. [2] Les documents disponibles décrivent surtout l’exemple de la warfarine, un anticoagulant pour lequel des variations des gènes CYP2C9 et VKORC1 ont été étudiées afin d’estimer plus précisément la dose initiale. [1] [2]

Que mesure un test pharmacogénomique ?

La pharmacogénomique étudie les associations entre les variations des gènes d’une personne et sa réponse à un médicament. [2] La présence d’une variation génétique ne suffit pas toujours à prédire à elle seule la réponse réelle, car des facteurs cliniques et démographiques peuvent également intervenir. [1] [2] Dans le cas de la warfarine, l’âge, le sexe, les maladies associées, les autres médicaments et l’alimentation figurent parmi les facteurs non génétiques décrits comme influençant la dose nécessaire. [1]

L’exemple des gènes CYP2C9 et VKORC1 avec la warfarine

Le gène CYP2C9 code une enzyme qui joue un rôle majeur dans le métabolisme de la warfarine. [1] [2] Certaines variations de CYP2C9 sont associées à un métabolisme réduit du médicament et peuvent modifier le délai nécessaire pour stabiliser la dose. [1] Le gène VKORC1 code la cible de la warfarine, et ses variations sont associées à des besoins différents en dose. [1] [2] L’objectif envisagé du test est d’associer ces informations génétiques aux données cliniques pour mieux estimer la dose de départ, et non de déterminer automatiquement une dose à partir du seul résultat génétique. [1] [2]

Ce que le résultat ne remplace pas

Pour la warfarine, le test pharmacogénomique ne supprime pas les contrôles périodiques du temps de prothrombine et de l’INR, qui servent à évaluer la coagulation et la réponse au traitement. [2] S’il est utilisé dans ce contexte, le résultat génétique doit être interprété avec l’INR et les autres facteurs susceptibles de modifier la réponse au médicament. [1] [2] Les synthèses de 2009 et 2010 fournies dans ce dossier reconnaissaient une relation entre certains génotypes et la dose de warfarine, mais elles jugeaient encore insuffisantes ou non concluantes les preuves d’une amélioration directe des résultats cliniques grâce au test. [1] [2]

Quand le test était envisagé dans l’exemple de la warfarine

Le test de CYP2C9 ou VKORC1 était décrit comme idéalement réalisé avant le début de la warfarine afin d’aider à estimer la dose initiale. [2] Les caractéristiques génétiques personnelles étant considérées comme stables, ce test précis était présenté comme n’ayant normalement pas à être répété en l’absence d’une raison de penser que l’information initiale était inadéquate. [2] Ces indications historiques américaines ne permettent pas de déterminer dans quelles situations un test pharmacogénomique est actuellement proposé, recommandé ou pris en charge en France. [1] [2]